巍峨瑰丽，雄冠远东教区之圣保禄教堂和修院，自一八三五年被毁后，耶稣会士既早遭逮捕，故教堂之重建，实再无人代谋矣。留下断垣残瓦，沦作废墟。遂由议事公局于同年四月八日，委派主教之代办人佛郎高神甫(Candido Goncalves Franco)将其辟作坟场，盖其坭墙甚厚，可以挖空内壁，埋棺墙中，一如古代罗马之宗教葬礼。迨至一八三六年五月十四日议事公局再将之交与仁慈堂管理。令凡来葬者，均须纳费以充善款，并指定以五千元另辟贫者墓地。此种办法虽已获得仁慈堂同意，但当时之亚马勒兵头(Ferreira do Amaral)，竟于一八三七年二月九日颁一谕令，着该坟场应按照教会规律，交回教会管理，定于六月一日开始执行。又在一八三八年令将各危墙一律拆矮──至二十五尺高，以保安全。一八四三年海外殖民局曾寻得一记载，兹录述如下： “大三巴遗址利用作坟场办法，将各危墙改矮至一半，各废柱平衡排置，另用砖砌成一小道于其上，直贯全场。教士古墓则开穴墙中，各普通坟则平葬道旁，入路两傍之拱窿则放置骨石。于教堂旧址另筑一小祭坛，以为葬礼前之祭祀处。场内遍植柏树。凡来葬者均须缴税，拨充仁慈堂善款。场外邻近，预留将来扩充余地。石门牌坊则保存无损，俾资后人瞻仰。此种任务，从一八三七年起，交由圣约瑟修院(College of St. Joseph)之上司负责。”云云。自圣保禄教堂和修院遭焚后，当局迺将其残址改作坟场。原来教堂背后之钟楼上，本有大钟两面，迺澳门旧日出名之波加劳造炮厂(Tavares Bocarro's Foundry)所铸者，亦被迁移安置于牌坊之第二层左右两窗框内，作为葬礼鸣报丧钟之用。嗣是该坟场一向被沿用，作为教徒及西人之墓地，直至一八五四年十一月二日才停止安葬。至一八七八年鸦高士子爵(Viscount Pa ç o d’Arcos)来任澳门兵头时，迺下令将前时所葬下各墓，一律迁葬于西洋坟(St. Miguel)内。所有断壁危墙，悉数夷为平地。至是两个古钟，亦失其所在。所遗之教堂残碣及墓碑，或移作邻近房屋建筑墙脚，或用船载往吕宋之马尼刺(Manila)，敷砌古城街边。后来更将牌坊背后之废地，辟成花圃草坪，门口加建铁闸，用以点缀和保护此名胜古迹。迨至近年各处旅客来游日众，澳门工务局遂将该牌坊右侧修院废址(此地曾为贫民巢窟，尝遭火灾多次，后来当局迺将贫民移居台山，尚遗留破屋多间)之破屋拆去，新辟一斜坡马路，以利汽车来往，从此游客称便矣。大三巴牌坊，即为澳门名胜古迹之一，亦为澳门唯一之突出标志。历尽数百烽火风暴，犹安然独存。曾经吸引多少古今名人，几许中西游客，为之兴怀，为之歌咏。在中国诗词方面，前章已略举例。至于西文诗歌，最能哙炙人口者，当推一八五五年香港总督包令约翰 (Sir John Bowring)所写之“荣哉宝架”：(In the Cross of Christ Glory!)—歌，其曲谱又为英国音名家康奇(Ithamar Conkey)所作，称为世界名曲之一，惜其歌词太偏重宗教。三巴古坊，百年残阙，已荒废久矣。岂料当二十世纪初期，还有人想设法重建之者，盖在一九○二年时，澳门公教会中，有一位长老名约瑟黔枚神甫(Rev. Dr. Antonio Jose Gomes)，痛惜梵宇类荒，自愿竭力护法，迺不辞劳苦，百方筹募，终捐得白银一万六千九百多元。在六十年前，澳门工资物价皆极低廉。募得此项巨款，实较重建预算所差无几。于是着手策划，绘备图则，务求尽可能依据原日之圣保禄教堂模样，照样筑回一所。讵知其年高任重，积劳成疾，以致宿愿未偿，身已先死，自后继志乏人。且闻捐得之款，曾由其经手存于银行，现在没人合法提取，致使重建圣保禄教堂之议，终成泡影也。至于圣保禄教堂之本来面目究竟如何？应如何照样重建？此迺必须解决之问题。据闻当教堂尚未被焚前，曾有一位英国著名画家佐治千拿厘(George Chinnery)居留在澳门，后来其遗作多珍藏于英伦及罗马等博物院，或对教堂所绘，有足资参攷者。且在一七二六年还有一荷兰雕刻，曾显示该教堂迺在炮台下方，楼高二层，中有一尖塔，但不甚高云云。整座教堂形式，既可研究得之。但吾人如今面对现实，举头可见牌坊，堂皇宏伟，留心细看雕刻，精致玲珑，其建筑之壮丽，其艺术之奇巧，在在令人称羡，处处足供研究，故再不避愚陋，只就大三巴牌坊之门面所见，分为“艺术建筑之构成”，与“宗教雕刻之表现”。

万历三十一年（1603年2月11日─1604年1月30日）12月24日，新圣保禄教堂正式落成。教堂有160掌长，84掌宽。正面3座大门朝南洞开。石砌墙壁约50掌。堂身依三路伸展构成3个祭堂，即一个主堂及两个侧堂。数个祭堂沿教堂两侧排列，后部左右两翼各有一祭坛：圣灵坛与圣米格尔堂。圣堂供奉《圣母玛利亚升天图》。主堂长62掌，宽44掌，唱诗坛旁摆放两台风琴。教堂旁还建有一座钟楼，其大钟是由后来法王路易十四（Louis ⅩⅣ）赠送。1637年到澳门的英国旅行家彼特•芒迪（Peter Mundy）参观该教堂后称：“教堂屋顶是我见过最漂亮的拱形建筑。中国人巧夺天工，木制雕刻以新奇古怪的红、蓝等色彩勾画得美轮美奂。整个穹窿为若干四面体，而每个四方形之间以巨大玫瑰花和绿叶重叠相连。”教堂工程由瓦伦廷•卡瓦略神父主持，设计师为卡罗斯•斯皮诺拉（Carlos Spinola），但斯皮诺拉却未看到自己设计的成果，于1602年7月就已经赴日传教，他在澳门停留仅1年10个月。Maria Regina Valente, Igrejas de Macau, pp.15—17.Domingos Maurício Comes dos Santos, Macau, Primeira Universidade Ocidental do Extremo-Oriente, pp.14—15.梅迪纳：《澳门大三巴教堂建筑师》，载《文化杂志》第21期，1994年。

大三巴牌坊，其建筑固宏伟，而其彫刻更精巧。其对宗教之宜传，直教石头去说法。仅就一幅门面石壁，竟能把耶稣会之教义，都发挥无遗，据天主教徒解释。牌坊上之彫刻，有如下之含义：牌坊之顶层，作三角形。顶端有一铜十字架，是天主教徽号。三角形之中心，嵌一铜铸之白鸽，是象征天主教之圣神，有四颗星辰，环绕四周，两傍更有一太阳，一月亮，表示圣神是站在日月星辰三光之中。换言之，圣体有定时通过上帝恩赐而出现云。牌坊之第四层，正中有一尊耶稣基督铜像。边栏刻有菊花，以显示神圣纯洁，此原属日本人之习俗，盖日本人以菊花为最神圣纯洁之物，说日本人建筑牌坊，足征信矣。耶稣像之两傍，各刻有一个耶稣信徒之浮雕。右便是圣保禄，左便是圣彼得。更右傍有绳一条，表示惩罚之意。更左傍有麦一束，像征约瑟和大卫之居。最后之两傍柱身，各刻一东方笑狮，表示其宗教已及于远东云。牌坊之第三层，迺整座牌坊所有雕刻物含义之重要中心。中央为圣母马利亚(Virgin Mary)铜像。周围绕以玫瑰和百合花，以表示纯洁之意。更刻有六个天使，或礼拜，或焚香，或歌颂，所以显示虔敬云。圣母像之两傍，左便刻一生命树，右便刻一喷水泉，此二物均属天主教圣经中所说，伊甸(Eden)乐园中之灵物。离生命树傍，另有一幅浮雕，题有中文“圣母踏龙头”五字，刻有一条七头翼龙，中间之魔首顶上，立一圣母。此迺圣经所传说，昔一女人毁灭魔蛇之事迹，是中世纪时代之神话。七头翼龙之左，又有一幅浮雕，刻着一具骷髅，横卧地上，手执箭矢，傍置镰刀，是象征死神者，故题有中文 “念死者无为罪”。离喷水泉之傍，又有一幅浮雕，刻有一艘古式帆船，上方为一位圣母，此迺表示传教士航海东来，得到圣母保护。又因耶稣会士筹建此圣保禄教堂时，据说日本货船得圣母庇护，平安归澳，曾捐助货值百分之点五巨资，遂得筑成此牌坊，故教会人士谓，此帆船实为不可缺少之雕刻也。在帆船之右，又有一幅浮雕，刻有一只怪兽，被箭刺著，张牙舞爪，备极凶恶，是象征魔鬼者，故亦题有中文“鬼是诱人为恶”等字，两傍尽处，亦刻有东方笑狮。牌坊之第二层，只有四导铜像，及三个窗门，正中之门较大，两傍各刻一棵棕树。左方棕树之傍，其铜像为圣方济各沙勿略(S. Francisco Xavier)，故像下刻有S. FCOX字样。隔窗更左处，其铜像为亚莱萧江沙加(B. Lviz Gonzaga)，故其像下刻有B. LVIS，G等字，右方棕树之傍，其铜像为圣依纳爵罗耀拉(S. lgnácio Loyola)，故其像下刻有S. IGNA字样。隔窗更右处，其铜像为方济各波芝亚(B. Francisco Boria)，故其像下刻有B. FCO. B.等字。该四人者，天主教信徒皆称之为圣人，盖用以代表东来传教之殉难者云。牌坊之最下一层，只有大门三道。各柱傍门侧，均作棱形或长方形之图案。正门楣上，刻有拉丁文圣母二字，表示救世者，愿世之欲得救者皆入其门。两傍之门楣上，所刻耶稣会之简写I.H.S.三个字母，可作拉丁文(In Hac Salus)之减笔，作“借此十字架可以得救”解释云云。兹将澳门评论英文月刊(Macao Review) 之著者佛兰斯士(J. D Francis)所解释牌坊上之石刻意义，翻译如下：“此为一神学之石刻。集合一切圣人，其中以圣母主之。总而言之，其顶层，首先通过圣人工作；次层，是基督化人，代世人受难，牺牲死亡，克伏魔鬼；中层，通过圣母，使人得到恩赐，更由圣母力量而得永生。所以救世，是上帝藉耶稣功德，给人们以灵魂。其下之二层，是通过圣母及诸圣人之功德，而使人们得救”。整座大三巴牌坊之石刻，在宗教家看来，确像一本圣经；在艺术家看来，确属一幅精美图案；在历史家看来，乃一宝贵古迹，其价值诚有不可磨灭者也。关于大三巴牌坊之历史，前人每多不求深究，致附会多端，或视作神秘非常，或说成谎诞不经，以至误妄百出，讹传失实者，兹且举数事，并辩正之：常有阅读历史或澳门纪略等书，见载澳门有天主堂名唐人庙者，辄附会以为唐人庙即三巴寺或疯堂寺。其实皆错，盖唐人庙已在雍正十二年二月二十日，被中国海防同知张汝霖封禁矣。《香山县志》载：“雍正十二年二月张汝霖奉督抚檄，委香山司巡检顾麟，集殷商蔡泰观蔡宝观等，会同县丞顾嵩封唐人庙。”又张汝霖《为封唐人庙事论澳夷檄》云：“…至该夷目呈称，此寺并非唐人建立，称唐人寺迺讹言相沿。不知唐人寺之名县志有载，即通志亦载其名，进呈御览。如以唐人寺为讹传，将志载三巴板樟等寺亦讹言相沿乎？又称本国王令寺宇系重伏乞恩祐等语。夫今之所封乃唐人进教之唐人寺，非尔夷礼拜之夷人寺也。三巴诸寺，以尔夷人奉尔教原不禁止。”观此则足知三巴寺，不在张汝霖所封禁之列，其不是唐人庙也明矣。又有谓牌坊顶之铜鸽和十字架原属金制者，曾被人盗去而易以铜制者代之。殊不知该铜鸽和十字架在初建时，由澳中著名之波加劳铸炮厂，与铸铜像铜钟同时用铜铸成者，详载柏力架著之《著名制炮厂》一书(A Celebrated Cannon Foundry by J. M.Braga，1943.)所传金制是捏造者。至于传说坠道之如何深远诡秘，附会天灾节是火烧大三巴之无稽，前章早已辩明，兹不复赘。总之大三巴被毁，说是由天火所致，未免太玄。禁本谓为逸马伤田，农民报以一炬，则尚属可信。诚如是，则大三巴牌坊，其为早岁之澳门农民运动一纪念碑碑欤！

攷证于今阙禁书，烬余凭吊认僧居。故宫一样今禾黍，壁影斜阳落废墟。大三巴牌坊，为澳门有名古迹。其初本为旧日圣保禄教堂之前门石壁。在明朝末季，吾国人称圣保禄教堂为“三巴寺”。“三”者，为(San)圣字译音，“巴”者，为(Paul)保禄合并译音。又因当时澳门，另有三巴仔教堂，故以“大”字区别之。合称为“大三巴”。后来三巴遭火焚毁，只留得前门石壁，岿然屼立，有如一座牌坊，故人遂称之为“大三巴牌坊”。大三巴牌坊，具有悠久历史，其年代之邃古，建筑之瑰丽，传说之神异，皆足供后世宗教家之景仰，艺术家之赞羡，历史家之研究。所以古今图画，中西典籍，都每有记载。中国古籍中，如《香山县志》、《澳门纪略》以及一些名人笔记等，均常记述之。但惜略而不详，或记其建成之外貌，或述其毁后之残迹。而对其历史内容，成毁原因等，皆少述及。致令后人对忖测臆造，说成神秘。信徒教友，更夸称圣灵。传说谬误，甚至以讹传讹，像煞有介事者。攷其原因，所以致是者，良以当时中葡言语文字之差异，感情又猜忌隔膜，所以无从探讨纪述耳。例如葡人蒙特托朱萨士著之《澳门史(Historico de Macau)》曾载称：“当圣保禄教堂兴建时，四周围以木板，务使外人不能窥见其中建筑情况，致中国人，皆疑葡人有秘密建筑炮台情事”。又如某英文书本，尝详述圣保禄教堂被焚实情，致遭禁售。是以昔日梁哲士先生尝赋《大三巴牌坊怀古》诗云：“攷证于今阙禁书，烬余凭吊认僧居。故宫一样今禾泰，壁影斜阳落废墟。”盖亦有感而作也。吾人苟欲攷察大三巴牌坊。首先要研究圣保禄教堂之历史，盖圣保禄教堂之历史，即大三巴牌坊之历史也。吾人既因中葡语言文字之隔垓，又因猜疑禁忌所阻挠，故对其历史始末，难得其详。如中国古籍中之《香山县志》、《澳门纪略》及《帝京景物略》等，皆只作如下之简略记述：“寺为三巴，在澳东北，依山为之。高数寻，屋侧启门，制狭长。石作雕镂，金碧照耀。上如覆幔，旁绮旒瑰丽，所奉曰天母，名玛利亚，貌如少女，抱一婴儿，曰天主耶稣，衣拜缝制，自顶被体，皆采饰平画，障以琉璃，望之如塑。旁貌三十许人，左手执浑天仪，右叉指，若方论说状。须眉竖者如怒，扬者如喜。耳重轮，鼻隆准，目若瞩，口若声。上有楼，藏诸乐器。有定时台，巨钟覆其下。立飞仙台隅，为击撞形，以机转之，按时发响。僧寮百十区，蕃僧充斥其中”。又古来名人笔记中，所述亦大略如是，最著名者如龚翔麟《珠江奉使记》，其中有云：“其寺曰三巴，高十余丈。于屋侧例启门户。石作彫镂，金碧照耀。寺僧曰法王，以时集男女礼拜。其所奉曰天母，名玛利亚，抱一婴儿，曰天主耶稣。被服珍怪，障以琉璃，望之毛发生动，云汉平帝时人也。寺有风琴，其琴钢弦，弹之以和经颂。并管萧诸乐器，藏机木柜，联以丝绳，轮牙相错，一人转机，则诸音并奏，有定时台，巨钟其下，立飞仙台隅，为击撞形，亦以机转之，按时发响，起子末一声，至午初十二声。复起午末一声，至子初十二声，昼夜循环无爽。前揭圆盘，昼十二辰，俟某时钟动，则蟾蜍移筹指某位。”中国古籍中之地方志书，及名人笔记，其对圣保禄教堂之叙述，大概有如上述，都略而不详，难供历史研究佐证。兹试再将古今诗人墨客，对三巴寺有关之题咏，选录数首于下，俾资欣赏，或作史料研究如何？迹珊诗：“暂别殊方物色新，短衣长帔称文身。相逢十字街头客，尽是三巴寺里 人。箬叶编成夸皀盖，槛舆乘出比朱轮。年来吾道荒凉甚，翻羡侏儒礼拜频。”屈大均诗：“礼拜三巴寺，蕃官是法王。花襔红鬼子，宝鬘白蛮娘。鹦鹉含春思，鲸鲵吐夜光。银钱幺凤买，十字备圆方。”钟凤石诗：“插汉三巴寺，耶稣律自持，占星亦有术，重女却奚为。践土封无外，通商政不私，羁縻原勿绝，他族尔毋滋。”金采香诗：“三巴门内瑞云开，夷妇殷勤礼拜来。席地跌跏忘永日，氲氤人气绕楼台。”丘沧海诗：“天主堂高十字支，筑从新教未行时。嵌空万石玲珑甚，独少流传景教碑。”梁哲士诗：“魏峨可是鲁灵光，屹立千寻賸古坊。劫后红羊伤逝者，当年教祸属强梁。”汪慵叟诗：“乾隆全盛时，禁封唐人庙。畏怀岂无术，所贵树声教。一废不复兴，绿芜黯斜照。堂陊门犹存，雕石弥晃耀。鞾帕迎汉官，故事足凭吊。”以上各诗，都是古雅铿锵，对三巴寺之史实，感怀兴叹备至，但惜事实仍欠详尽，未足供历史参攷。现只得从西文典藉探索，史料较多。故不惴冒味，将三巴寺历史，划作三个时期，研究分述于后。即，筹建时期；建成时期；及毁后时期。

考古学是一门通过对古代人类在各种活动遗留下来的实物，研究人类古代社会历史的学科。在澳门，考古工作自1972年开展至今，开展了规模大小不一的多次考古发掘工作，其中，圣保禄总院遗址在2010年至2012年开展的考古发掘中出土了大量克拉克瓷，印证了澳门历史上瓷器贸易的繁盛，也引发人们思考这些考古发现和圣保禄总院的耶稣会士之间存在的联系。

圣保禄教堂，原乃葡国天主教之耶稣会(Jesuits)教士来澳所筑者。其初只建一小修院，不久又增设一小教堂，及后再扩大，遂成为后来之圣保禄教堂及修院，兹将从西文典籍所搜得之历史记载，详为译述于后。攷葡萄牙人之东来。其所到各地，必有天主教教士，接踵随来者。自从一五一四年，葡人初到中国之上川岛后，不久，就有耶稣会始创人，葡属果亚之天主教方济各沙勿略(Francisco Xavier)，于一五五零年来到上川岛，但谋入广州不遂，殁于岛上。迨至一五五七年，葡人入居澳门后，接着又有耶稣会教士彼利士（皮雷斯） (Francísco Peres)神甫，爹利亚(泰玛诺)(Manuel Tiexeira)神甫，及品度（平托）(Andre Pinto) 修士等三人，于一五六二年七月廿六日，来到澳门，筹划树立天主教之远东基础。此即圣保禄教堂之创办人也。据一五六三年爹利亚神甫，向葡国之耶稣会报告有云：“……盖澳中已有三百葡人，需要耶稣会建立教堂。”于此可见，当时耶稣会已立意兴建圣保禄教堂矣。至一五六五年十一月廿一日，耶稣会教士，实行在小丘山傍，用木板土石等，筑成一座栈仓型小室。此等栈仓房，葡人惯常用作创办传教基地。如在巴西及其他各处殖民地，亦都如是创立者。在一五七二年时，该室遂被扩充为研习拉丁语文，及神学等之潜修所。当时由主管人安东尼华士(António Vaz)主持，另有耶稣会神甫八人助理之。作为培养天主教传教士之远东中心基地也。自从一五七二年，耶稣会在澳门建立起该所传教基地后，大得葡国舍巴施莺葡王(D. Sebastião)之赞许，并获谕令，由麻六甲（马六甲）海关税项下，每年拨助一千元，充作该所经费。至一五七九年，葡国红衣主教殷利基(Cardial D. Henrique)承袭王位后，每年增拨一千元。该所由于得到充裕补助，逐渐改建成为一间设备稍具完善之修院矣。此项补助经费，直至葡王约翰四世(D. Joáo IV)时，即一六三九年才停止供给。一五八零年，罗明坚神甫(Miguel Ruggieri)到澳门后，更于该修院之山傍，增建一座小教堂，以为华人祀奉圣母者。现时大三巴之遗址，即圣保禄教堂之前身也。后来，教廷于一五九四年十二月，委范礼安神甫(Fr. Alexandre Valignano)到澳视察，后者奉命将该修院及小教堂，分为两部管理，并令加授法律一科。但不数年，两部又复合并为一。统由洗尼拿神甫(Manuel Dias Senior)总理之。且又加授一科艺术。嗣后，天主教徒，遂认为该修院与教堂，是一间纯粹属于圣母无原罪之神圣教堂与学府矣。该学府，后来竟扩展为一间远东闻名之圣保禄修院。由该院出身之学徒，皆具有大学程度。又因当时西方之学者，东来中国后，多聚居于此，故该院所存之图书，实为一时最完美之宝藏也。据贾典神甫(Fr.Cardim)一六四四年所著之记载有云“耶稣会于澳门高处，建此修院，经常可容六十人。其所授科学，由文法以至神学，皆有可得博士学位之程度者云。” 自从一五八零年，罗明坚神甫在澳门奠定此一间教堂联同修院，作为远东传教基地后，十余年间，设备已臻完善，而蓄积及藏书，亦渐丰富，但在一五九五年，一场火灾，将整座教堂，联同修院，完全焚毁。所有积蓄及藏书，亦难幸免。据前澳门代权官傅列打士(Guimaraés Freitas)所著之《澳门忆述》，其中曾记述该教堂修院之图书室云：“其藏书室真是神奇诡秘，传说埋藏在隧道中之密窟内，丰富珍贵，及宝藏甚多，但为火灾焚毁，损失无余。因此澳门之古典文献及纪录，所遗无几矣。” 该教堂及修院，自经过此第一次火灾后，耶稣会以传教之需要，不容缓置，故不久又复照样建回一所小型之教堂及修院。不料至一六零一年，又遭第二场火灾，只烧賸修院之一个讲堂，权作教堂用耳。按爹利亚神甫所记“……在一六零零至一六零一年间，未到日本前，此教堂和修院，实为在中日两国传教之枢纽，故修院内，设有研习神道学，拉丁文学，及艺术等三科，但已无地方供作研究圣经之用矣。当火警发生时，居民奋力汲水灌救。因人多挤拥，几连圣体也找不到出路搬走。起火时，由教堂蔓延，烈焰冲天，整座教堂尽艘，只余残壁。幸修院之讲堂无恙，火焰越过讲堂，燃烧三科研究室，无一幸免。所以事后，只得暂将焚余之讲堂，权作教堂，以待将来筹得款后，再谋重建耳。” 该教堂和修院，自遭遇第二次火灾后，本澳之葡商及市民，甚望作第三次重建。故对筹划捐款，皆甚踊跃赞助。其详情据花奴基利刺年报(Annual Report of Fr.Fernão Guerreiras，1601 — 1602)载称： “教堂既受上帝光荣之火洗礼，当时有三大火头焚烧，全澳市民，不论男女，皆来帮助灌救，事后，全市民商，齐集甲必丹前开会，讨论筹款重建办法，盖当时有一葡国商船，载货往日本销售，在归程中，半途失踪，倘该货船遭遇不测，则全澳葡商将会破产，若能平安获利归来，各商人均愿将该船货物所值百分之点五金钱，捐作重建教堂之用。果然不久之后，该失踪货船，竟由日本获得厚利归澳，因此耶稣会迺筹得不少捐款。计有三千一百三十巴度金元云云。”(每一巴度金元，约值现时港币一百元) 是次筹款重建教堂和修院，获得全市葡商热烈支持，捐得巨额金元。所以耶稣会士加意设计重建，筑成如是魁宏瑰丽之教堂，致令今人见到其遗留下来之前门石壁，即大三巴牌坊，犹惊叹赞美。当时重建教堂之图则，是由士扁奴刺神甫(Carlos Spinola)设计。约在一六零二年兴工。故今在大三巴牌坊右侧墙脚处，尚可见到当年兴工奠基时所置之石牌， 石上刻着之拉丁文(Virgin Magnae Matri Civitas Macaensis Libensposvit.an. 1602)，意即“澳门市供献与至崇之圣母，一六零二年”。 此次重建教堂，自従于一六零二年奠基后，最先在后面建成一所教堂，暂作应用。所以其始初之门面，不似现在牌坊之美丽，且是次重建工程，着重坚固精美，故费时颇久，后来得到日本教徒参加工作，始克完成。盖天主教在十六世纪时期，流传于日本长崎一带地方，当时日本人称之为“切支丹”。后来因为日本政府严禁奉教，致许多日本天主教徒，都受到迫害。尤其是在一六二二年九月十日之一次大事变后，日本之天主教徒，纷纷逃来澳门，藉国外宗教庇荫，来三巴门附近一带匿居。其中不少是建筑家及艺术家者。因此，耶稣会士认为是一好机会。利用以工代赈方法，招集此等日本教徒，来建筑教堂，及宏丽之前门石壁。且如此办法，工资廉宜，悭回不少经费，因为此次工程，历时长久，经费浩大。而前时所筹得之捐款，虽不算少，但仍感不数。故建筑方式不得不采取逐步完成办法，随时征求募款。迄至一六三七年，前门石壁之工程始告竣。斯时彼得文地神甫(Peter Mundy) 适来澳巡视，迺令将教堂与宏丽之前门联合起来，盖此种联并建筑法，颇属出于勉强者。致人今仍可从其遗迹看到。因现时牌坊之背后，尚留有旧日教堂联并时，其屋顶之砖痕，殊非出于自然建筑者。至于教堂门前之许多石级，更为后来一六四零年始添筑者。攷其初时，想仍未有建筑石级之意，故其建修院时，尚无预留建石级之位置。致令后来所建之石级，偏侧一便，不能正对前门。此等逐步添筑痕迹，至今仍斑斑可攷。

大三巴牌坊，即圣保禄教堂毁后所遗留之门阙，其造型为意大利教堂格式，迺欧洲中世纪盛行之建筑样式，与西班牙型接近，是文艺复兴时期之建筑，和东方艺术混合构成者。故其绝不类似葡萄牙之建筑物，而多仿巴西及葡属各殖民地之建筑形式。圣保禄教堂之建筑设计者，迺士扁奴刺神甫。来自意大利，曾认识罗马之耶稣会教堂“谢萨”(The Church Gesu)。其或以谢萨堂之图则为蓝本，配合当年逃难来澳之日本教徒中建筑家、艺术家等意见，参杂多少日本色彩，遂建成此一座东方之天主教代表建筑物。该牌坊之门面，是一幅具有雕刻装饰，可分为五层图案建筑面。完全为花冈巖砌成，有四种不同式之石柱，用几何式长方形石础互相支撑，并嵌以各圣神之铜像。各铜像及顶层之铜鸽，皆为当时澳门有名之波加劳铸炮厂所造，门前有石级一幅，亦可分为六层，每层有十一级，连上下合共有六十八级。两傍有石栏干，其最上层和最下层皆作平台，用长石铺砌。门前有中国式之石围杆夹一对，现已失其一矣。整个牌坊分作五层，兹逐层分述于下。牌坊之底层，为入门处。有门一道。间以较粗大之伊安匿式(爱奥尼亚式)(Ionic)石柱，分作四排。正中门较阔大，门楣上刻有圣母(Mater Dei)二字，两旁之门，其门楣亦刻有耶稣会简写之(I.H.S)三字母。[1] 牌坊之第二层，亦有石柱十枝，皆作罗马建筑艺术之可连特式的(科林斯柱式)(Corinthian)，与底层之石柱相连系，但较为幼小耳。互相间隔，有窗户三，居中者较大，但各窗框，已毁灭无存矣。另有石龛四个，各立耶稣会之圣人铜像一尊。但根据罗马教堂惯例，其教会之首创人像，应立于入门之上方处，故该堂初建原意，本欲铸圣保禄(St. Paul)及圣彼得(St. Peter)二人之铜像，置于第三层之突出处者。后因当时欠缺经费，致未能照办。牌坊第三层之正中石龛内，置有圣母铜像一尊。两傍有石柱六枝，皆属联合式(Composite)雕逐工精。其余竖立堂顶者，皆为多力式(多拉克)(Doric)之简单石柱也。牌坊之第四层，亦有联合式石柱四枝，柱身较为粗壮，盖所以支撑顶层也。正中石龛内，立耶稣基督铜像。两傍另有圣保禄及圣彼得二人石刻浮雕，此二像本该用铜铸成，置于第二层之重要地位者，但为节省金钱计，故改用石刻浮雕而置于第四层。其二人拉丁文名圣保禄(St. Pavlo)及圣彼得(St. Pedro)两字，则分刻于两傍最开之柱趸上，此显然出于勉强。牌坊之顶层，为一二等边三角形面。边沿作歌匿士式(Cornice)之线条。正中镶铜鸽，顶端坚一十字架，两傍各立饬柱两枝，状颇巍峨。牌坊由第三层至第四层之内壁，有一暗道相通，可达顶端者，作为清洁各层时之通路。其暗道在圣母像和耶稣像之后侧，不易被人发现。牌坊之地底，筑有隧道两条。一条上达大炮台，另一条下通至关前街之李家围内。现今该隧道之出口，仍然存在。但已被封闭，不得进内耳。盖当时澳门治安不足靠，抢劫者有之，仇教者有之，故耶稣会士，筑此隧道以防不虞，收藏财宝，及遇有意外时，预作逃避后路也。查该隧道，早在小型教堂时期已设备。当一五九五年第一次火灾后，澳门代权官传列打士所著之《澳门忆述》中，曾纪录其事。不过当年之隧道，只属略具规模，后再扩大，竟通至李家围耳。惟后世一般谣传，更夸大其说，或言该隧道可通至东望洋灯塔；或谓其可通至青洲教堂；更有说其可达对海氹仔路环者，此皆不足信也。又传其中藏宝甚伙，都属忆说，盖无人能进内探其究竟，至今尚属一个谜。据葡人蒙特托朱沙士之“澳门史”所载：“当一七六二年耶稣会士被逮解离澳门时，皆是孤身无物。想其财宝早已安排处置妥当者。假使果真埋藏隧道内，亦当被其后来迁徙耳。盖事后之耶稣会士有化装潜逃返澳者，且其中一人竟于一七七五年被选为议事局员，虽然后卒败露被斥。”大三巴牌坊，无论其传说如何神秘，建筑如何危岸，而香港大学工程科之师生和职员，曾于一九五二年六月同到澳门，对此大三巴牌坊，作过一番精密之测绘研究，当时搭棚探讨，摄影制图，对其建筑，已有详明之理解。

万历三十年（1602年1月23日─1603年2月10日）圣保禄教堂重建奠基，由佩德罗•卡瓦略神父主持。这次重建的奠基石碑至今犹存：Virgini Magnae Marti Civitas Macaensis Libens posuit An. 1602. 意思是：1602年澳门市民为童贞天主圣母所建。圣保禄教堂1602年奠基碑文，转自郭永亮：《澳门香港之早期关系》，第55页。