萬曆三十年（1602年1月23日─1603年2月10日）聖保祿教堂重建奠基，由佩德羅•卡瓦略神父主持。這次重建的奠基石碑至今猶存：Virgini Magnae Marti Civitas Macaensis Libens posuit An. 1602. 意思是：1602年澳門市民為童貞天主聖母所建。聖保祿教堂1602年奠基碑文，轉自郭永亮：《澳門香港之早期關係》，第55頁。

萬曆三十一年（1603年2月11日─1604年1月30日）12月24日，新聖保祿教堂正式落成。教堂有160掌長，84掌寬。正面3座大門朝南洞開。石砌牆壁約50掌。堂身依三路伸展構成3個祭堂，即一個主堂及兩個側堂。數個祭堂沿教堂兩側排列，後部左右兩翼各有一祭壇：聖靈壇與聖米格爾堂。聖堂供奉《聖母瑪利亞升天圖》。主堂長62掌，寬44掌，唱詩壇旁擺放兩台風琴。教堂旁還建有一座鐘樓，其大鐘是由後來法王路易十四（Louis ⅩⅣ）贈送。1637年到澳門的英國旅行家彼特•芒迪（Peter Mundy）參觀該教堂後稱：“教堂屋頂是我見過最漂亮的拱形建築。中國人巧奪天工，木制雕刻以新奇古怪的紅、藍等色彩勾畫得美輪美奐。整個穹窿為若干四面體，而每個四方形之間以巨大玫瑰花和綠葉重疊相連。”教堂工程由瓦倫廷•卡瓦略神父主持，設計師為卡羅斯•斯皮諾拉（Carlos Spinola），但斯皮諾拉卻未看到自己設計的成果，於1602年7月就已經赴日傳教，他在澳門停留僅1年10個月。Maria Regina Valente, Igrejas de Macau, pp.15—17.Domingos Maurício Comes dos Santos, Macau, Primeira Universidade Ocidental do Extremo-Oriente, pp.14—15.梅迪納：《澳門大三巴教堂建築師》，載《文化雜誌》第21期，1994年。

我們在上一篇文章提到大三巴秘道的金庫傳說，但秘道的傳說並不只有一個，另一個說法是秘道曾經是昔日傳教士們的避難通道，後來這個說法又衍生成為一個鬼故事……

萬曆八年（1580年1月16日─1581年2月3日）由於耶穌會天主之母教堂是用稻草搭蓋的屋頂，而當時常有華人放火燒房子，故耶穌會副省會長佩德羅•戈麥斯（Pedro Gomes）神父下令給教堂加蓋瓦片，並給教堂的地面鑲上木板。城市派來了許多奴隸，熱火朝天地幹起來，工程很快便結束了。Monumenta Historica Japoniae por SCHÜTTE, Josef Franz, S. J. , ed. lit. ; RUIZ-DE-MENDINA, Juan, S. J. in Japoniae Informationes 1549—1654/proposuit Josef Fraz Schütte S. J. , 1975, p. 386. 及Domingos Maurício Gomes dos Santos, Macau, Primeira Universidade Ocidental do Extremo-Oriente, p. 7.

攷教堂與修院之第三次重建工程，大部分由賈華奴神甫(Valentim de Carvalho)主持。從一六零二年起，至一六三七年止，歷時三十餘載，始克竣工。其取名為“聖保祿”，蓋用作紀念聖保祿，因他迺東方傳教之首者。此教堂雖被稱為聖保祿，但教堂內所供奉者，卻是聖母無原罪，據謂，澳葡王約翰，極寄信於此神者，故立聖母。聖保祿教堂和修院，擴建完成後，其建築之雄偉，修飭之華麗，設備之完善，皆堪稱為遠東教堂之冠。相傳謂只前門之石壁，即大三巴牌坊，其價值為三萬両銀云。因此，凡東來之傳教士，皆駐足於此。而東方各地之修道生，亦皆來此求學。當時之聖保祿教堂，實已成為天主教之東方總樞紐，經常與中國內地、日本、朝鮮、安南、呂宋之教會聯系。聞當一六四零年，日本仇殺天主教徒時，澳門派去之傳教士，及日本信徒，共有六十一人受刑而死，聖保祿教堂曾為之鳴鐘致哀，凡二十天始罷。在明末清初時期，中國名詩畫家吳漁山，亦嘗於他五十歲時(一六八一年)，來澳加入耶穌會，在聖保祿修院學道，甚一六八八年迺升為司鐸。其在澳時，曾著有《三巴集》詩稿，有澳門雜詠三十首。其中有云：“第二層樓三面聽，無風海浪似雷霆，去來畢竟輸鷗鳥，長保羣飛入畫屏”，其自註謂：“樓房概有三層，余眠食第二層樓上。”由此看來，重建後之聖保祿修院，是一所三層高洋樓也。聖保祿修院，是一座三層大洋樓，在聖保祿教堂之左側，與教堂相聯系，位於大炮台山麓。大炮台，保名為聖保祿炮台，本來亦屬耶穌會士所有。山上設有祭壇，下有隧道，可與聖保祿教堂相通。修院之前門，原在教堂之前方，即今之窮里口處，亦有石級可登。院內盡為修道生宿舍及研習室，一如今日之三巴仔修院焉。在聖保祿教堂門前之石階上，其左右兩傍，原來竪立圍杆一對，與中國之衙署或祠堂廟宇門前所豎立者無異，蓋中國舊日規例，要有高官顯爵，才準許在門前建堅圍杆，以炫耀其勳祿。聖保祿教堂亦然，因當時耶穌會之神甫，及其修院之畢業生等，多曾受到明清朝廷封官，到北京任欽天監之職。按照例規，聖保祿教堂門前，亦得豎立圍杆也。所以現在仍可看到其階前右方，尚遺留有一個石圍杆夾，但其左方之一個，則毀滅久矣。耶穌會士利瑪竇(Mateus Ricci)於一五八一年來到澳門，是時聖保祿教堂，尚未建築完成。只得暫住一時，便前往北京，將西方之天文，曆法，物理、數學，音樂，繪畫等學術，介紹與中國。嗣後，明臣禮部尚書徐光啟，採用其曆法，開局任用洋人，繙繹西洋學術。因而聖保祿之教士及畢業生等，迺得承襲中國欽天監職。如明末清初之湯若望(Joannes Adam Schall von Bell)，南懷仁(Ferdinandus Verbi-est)等，計數十人，皆曾榮膺中國官職。直至聖保祿再遭焚燒燬後三年(一八三八年)，中國才停止徵用保祿修院教士充當欽天監官職。攷當年天主教之來華傳教者，計有四個教會，屬耶穌會、多明我會、方濟各會及奧斯定會。澳門之聖保祿教堂和修院，即屬於耶穌會所辦者。蓋耶穌會士，最能瞭解中國人習慣，傳教工作無孔不入，如利瑪竇、湯若望等，改穿漢服儒冠，廣交文士大夫輩，故其傳教工作，得以深入內地。至於多明我會，及方濟各會等，在神學上，與耶穌會各存異見，常常發生爭執，互訴於羅馬教廷。但羅馬教廷不同意耶穌會，後來更謂其參加政治，遂被葡國政府解散。據“聖保祿”特刊(A Fachada de St. Paulo)載稱：“邦波盧侯爵 (Marques de Pombal)於一七五九年一月十九日及九月三日，命令將耶穌會解散，及將其在葡屬之物業財產沒收。當時澳門兵頭李歐爾(António Corte Real)，亦奉到葡屬印度總督沙丹拿(Manvel da Saldanha)命令，暫守秘密，直至一七六二年七月五日，葡國軍隊抵達澳門後，始將聖保祿教堂及修院封閉。及逮捕所有耶穌會士，交與多明我會看管。常時三巴仔之同夥、赤同様受到拘留、交與方済各會看管。待至同年十一月五日，才由葡艦聖路義士號(St. Luis)載返葡國。盡囚於聖朱利亞(St.Julivs)塔內。嗣是，聖保祿修院便沒歸澳門議事公局掌管。至於耶穌會士之財產，則或沒入國庫，或分撥與主教，議事局員，及果亞之執政人等。”嗣後，聖保祿教堂，遂由主教委派其他神甫管理，曾有一個時期，作為法國之神甫修養所。當時法王路易第十四世(Louis XIV)，曾贈送一個堂皇華麗大鐘，歷來相沿用著。又當一七九八年時，該堂及修院，因閒置無用，遂被葡國王子騎兵團部徴作扎營所。不久該團部雖遷移到奧斯定堂去(The Covent of St. Augustine)。但至一八三一年四月十三日，經施路華神甫(Inacio da Silva)宣稱，奧斯定堂已殘舊不堪用矣。據傳謂：“聖保祿教堂及修院，自從沒收為政府產業後，將來用作駐扎軍隊，是最好不過者。”直到一八三五年一月二十六日。因軍隊在聖保祿修院廚內，存入大量柴薪，致使教堂及修院，又招來第三次之大火災，按海外殖民局(The Maritime and Colonial Office)曽記載稱：“時近黃昏，時鐘正報六點，火災便開始爆發。火勢非常迅速，僅至八時一刻，整座聖保祿教堂及修院，已蕩然盡燬無存矣。”又據《中西交通史》稱：“所謂三巴寺，即聖保祿教堂。興建於萬歷三十年(一六零二)、一八三五年一月二十六日燬於火。但其門坊、至今猶屹然獨存。按起火之日為道光十四年十二月二十七日。不知與舊歷過年，是否有關。”但據某英文禁本曾詳紀其事，據謂：聖保祿教堂之後方，多為農民田畝。當軍隊駐扎該堂時，難免有逸馬傷田事，故農民恨之。適歲晚該堂積薪，致得機以洩憤，效楚人一炬云云。所以梁哲士先生乃有“攷證於今闕禁書，燼餘憑吊認僧居”及“當年教禍屬強梁”等吟句也。攷此次大三巴火災，是在耶穌會士被逮離開澳門後七十餘年，正是軍隊駐紮修院作為兵營之時，於一八三五年一月二十六日(即道光十四年十二月二十七日)下午六點正，初由修院近廚房貯柴處起火。當時隆冬傍晚，猛吹東北風。因此風高物燥，一起火就烈焰衝霄，非常迅速延燒及左傍之教堂。今試研究牌坊上各窗戶，其門框上左方之石陣，尚斑爛剝蝕，足證當年風挾火勢，由東北方撲來者。因古時之教堂皆屬木材建築，易招火患。且救火設備簡陋，故焚燒僅兩個鐘頭，至八點十五分，就將整座巍峨大教堂付諸一炬，只賸前門殘關，徒供後人憑吊耳，聞當時搶救所得，只是一些“聖人”遺骨。蓋信徒視之如至寶。故將之移供於花王廟及大廟頂內，而聖方濟各沙勿略之遺骨，初則暫存花王廟，後再移置三巴仔教堂內云。至於現時里巷訛傳，有謂大三巴火災是天災節源始，與舊日澳門之一場大風災有關，均屬無據失實者。蓋澳門當年之一場大風災，媽祖閣與蓮溪廟皆受摧殘。廟碑皆有載明，按重修媽祖閣碑誌云：“迨至同治甲戌十三年八月，忽遭風颶為災。海水泛溢，門頭既已傾跌，牌坊亦復摧殘，瓦石飄零，旅杆斷折”。又按重修蓮溪廟碑誌云：“同治甲戌之秋八月，颱風陡作，沙石狂飛，庭楹為之而圯，裡祀莫得而陳”。準此推計，大風災是在同治十三年八月，即陽曆一八七四年九月。而大三巴火災是在一八三五年一月二十六日下午六點，即道光十四年十二月十七日，相差四十年。且在隆冬歲晚，安來颶風電火。足見天災節是另一件事，不能相混。深恐以訛傳訛，致失事實，故在此略作辯證。

崇禎十年（1637年1月26日─1638年2月13日）聖保祿教堂正面石壁（俗稱大三巴牌坊）建成。該石壁全部以花崗石建造，並以耶穌式的畫面展現出時代風格，其裝飾手法相當古樸且具有一種協調有序的想像力和象徵力，包含有西方巴洛克（Baroque）風格與東方形象技巧相結合的種種成分，從而在外來與原有的結合之中，使葡萄牙、中國及日本的各種風格相互交融。該石壁無塔樓，由三排立柱將整個牆壁以縱列分為三塊。中間部分最高，且分為四層，另外兩部分分列兩旁。四層石柱呈疊式排列，底層為愛奧尼亞（Ionic）式結構，其他為混合式。上部正中哥林多（Corinthian）式柱漸縮成一三角形塔狀牆。有一銅柱鴿形物象徵聖靈。周圍四星環繞。右邊為太陽，左邊為月亮。石柱完整而與牆壁脫離，僅起裝飾作用。下部幾幅浮雕和壁龕擺放著塔瓦列斯•布拉嘉（Tavares Braga）設計的銅像，構成石壁裝飾的組成部分。整個建築整體頂部有一方尖物，中間石砌托座上豎有拉丁十字架。聖保祿教堂正面牆壁由三大部分決定了它的整體構成。第三層為聖母瑪利亞雕像。她站立在壁龕內，四周被玫瑰和百合花環繞，象徵純潔，六個天使分列兩旁對聖母表示無限崇敬。再向兩邊，左面是生命之樹，一條七頭龍被踩在聖母腳下，一幅骷髏及一柄劍，象徵死亡；右面三個天使身後是生命之泉，一艘迎風破浪的船在海上幸運之神的保護下航行。一個被征服的魔鬼頭顱及一個女人身體。正門上方是關於聖母的石刻題字“MATERDEI”，其周圍有花環繞。正門第二層及第四層還展示了其他一些雕塑品。如就置於中部壁龕的基督像，周圍環以百合花和菊花及其喜愛的器具。第四層是耶穌會的一組聖像。右邊是耶穌會的締造者聖依納爵（S. Inácio）和聖德波雅（S. Deborjal）；左邊是聖沙勿略和聖劉易斯•貢沙加（S. Luís Gonzaga）。嘉爾定（António Francisco Cartim）神父於1644年寫的著作中還提到另外兩座塑像，即聖彼得和聖保祿（S. Paulo）。這兩座雕像可能列入該石壁的最初修建計劃，但始終沒有付諸實現，僅僅是把他們的姓名刻於第二層兩側方尖形石壁銜接處，這表明當時確有將該聖像納入石壁裝飾的設想。教堂門外是一意大利石砌台階，寬8. 1米，共68級，以精心雕琢的石條整齊有致地鋪設於教堂前地。Maria Regina Valente, Igrejas de Macau, pp. 12—19. 很多學者認為石壁前的石階為1640年建，然1637年在澳門的芒迪稱：“教堂有一個新的美麗的前壁，通過許多台階可以登上它寬大的斜坡。”（Peter Mundy, The Travels of Peter Mundy in Europe and Asia: 1608—1667, Vol. 3, pp. 162—163）.

大三巴牌坊屹立在空中，俯視着澳門的土地。它是一座教堂的前壁，青蒼斑駁，巍峨壯觀。歷史的風雲從它身上掠過，東西的文明流經這裡匯合。滄桑巨變，歲月流痕，然而，它身軀猶健，神采依然，以無可質疑的資格，向世人展示着這座東方小城四個世紀的傳奇、風貌和精神。

很多地方都流傳著秘道的都市傳說，例如香港禮賓府的秘道、台北圓山飯店的密道等。當然，澳門也少不了自己的秘道傳說，當中最廣為流傳的秘道在澳門的地標——大三巴牌坊。