隆慶元年(1567年2月9日─1568年1月28日)3月17日，兩艘大黑船不肯通報， 便出現於澳門海面，本地居民疑為海盜船，地方兵頭瓦茲•維依加擂鼓下令，14 歲以上的市民拿起武器，保衛澳門。施白蒂：《澳門編年史：16—18世紀》，第16頁。

嘉靖三十四年(1555年1月23日─1556年2月10日)10月20日，葡商杜阿爾特•伽瑪的船滿載貨物從日本返回浪白滘。 同時抵港的還有瓦茲•阿拉貢(Diogo Vaz de Aragão)的一艘商船。 Rebecca Catz: coma colaboração de Francis M. Rogers, Cartas de Fernão Mendes Pinto e outros documentos, pp. 64—65.

隆慶五年(1571年1月26日─1572年1月14日)6月18日，葡萄牙國王唐•塞巴斯蒂昂頒佈法律規定，對擁有禁書的人處以沒收1/4乃至一半財產的處罰，情節嚴重者，還要被流放巴西或非洲，最高處罰導致死刑。李長森：《近代澳門外報史稿》第1章，第15頁。

隆慶五年(1571年1月26日─1572年1月14日)6月24日，菲利浦二世下令將馬尼拉升格為城市，並選出市長和各級行政官員。當西班牙人選定馬尼拉作為他們在菲律賓的活動中心時，澳門葡人由於有《托德西利亞斯條約》和《薩拉戈薩條約》的約束以及摩鹿加問題的前車之鑒，他們對馬尼拉並未感到興奮。當得知西班牙人迅速跟華人，尤其是福建人建立了貿易關係，澳門葡人更是不能確定其影響。中國人從福建出口到馬尼拉的絲綢越來越多，以致當它們被轉運到美洲之後已經給當地的紡織品製造者造成壓力。除此之外，福建人也帶去了糖和鐵，以及各種製造品，尤其是瓷器。這些商品有的被運往菲律賓群島內，還有些被帶去美洲。福建人不僅經營中國產品，還提供胡椒、珍貴木料，甚至從印度東部獲取香料。總之，西班牙人在菲律賓的出現帶來了新的需求，福建人對此作出迅速反應，從而在廣州、澳門的競爭中鞏固了自身的地位，也使西班牙人悄悄萌生直接進入中國市場的願望。Boletim da Filmoteca Ultramarina Portuguesa, n. 032, p. 18(以下所引Boletim da Filmoteca Ultrarnarina Portuguesa一書資料，均轉自加爾西亞一文，不另注)，轉自加爾西亞：《澳門與菲律賓之歷史關係》，載《澳門史新編》第2冊，第534頁。“馬尼拉”一名，原是從打家鹿文的“美”和“尼勒”字合成，意思是那裡有“尼勒”花的地方。“尼勒”據說是一種攀藤而開白花的小植物，現在打家鹿文叫做Ixora Manila(劉芝田：《中菲關係史》第6章，第369頁)。普塔克：《明代澳門與東南亞的貿易》，載《澳門史新編》第2冊，第383頁。

萬曆七年（1579年1月27日─1580年1月15日）安南南部黎朝攝政的占公主派使者至澳門，求見澳門教區署理主教賈尼勞，要求派傳教士至越南傳教。未果。Ò Vièt Nam, Giáo Hōi Cōng Giáo, p. 63.

嘉靖四十一年(1562年2月4日─1563年1月23日)12月26日，吉爾萬尼•蒙特介紹澳門時稱：當時澳門已有5000人，葡萄牙已婚者在這裡達到800人。Manuel Teixeira, Macau no Séc. XVI, p. 43; Manuel Teixeira, Macau e a Sua Diocese, Vol. 3, pp. 135—136.

嘉靖三十六年(1557年1月30日─1558年1月19日)葡人入居澳門半島的當年，就在半島東部建起了一座造炮廠。鄭舜功稱：佛郎機夷號稱海王者，蓋屋居止龍崖門，又聞市銅鑄造大銃。嘉靖三十六年(1557)，廣東政府允許葡人在澳門蓋屋居住，之前的三年，只能臨時搭棚貿易，貿易完即撤棚離去，而至本年，廣東政府批准葡人在澳門建築。黃福慶主編的《澳門專檔》第4冊《澳門界務說帖》第81—82頁稱：1557年，中國政府方准葡人建設工廠於該島之東。此為葡人在澳實行建築之始。龍崖門，霍韜的《霍文敏公文集》卷5《龍崖序》稱：”香山海濱，有峭石壁立，世呼為龍崖。“此龍崖當為龍崖門之由來，在香山海濱，故當指澳門，參見湯開建：《澳門諸名芻議》，載《澳門開埠初期史研究》，第78頁。鄭舜功：《日本一鑒》卷6《海市》。又霍與瑕的《勉齋集》卷19《處濠鏡澳議》稱澳門葡人“買馬造銃”。可見，澳門確實在開埠之初即已建有造炮廠。

隆慶六年(1572年1月15日─1573年2月1日)4月19日，設廣州府南頭、廣海海防同知一員，駐紮於雍陌。為建關閘後主要盤查官員。後因稅監以市舶相臨，海防同知辭回省城，至萬曆末議定，海防同知仍駐雍陌。海防同知的設立主要是加強明政府對澳門的管理，其職責是“會同欽總官訓練軍兵”，對從水陸兩路出入澳門的“番舶”和“番人”“嚴加譏察”，還要協助管理澳門的稅務工作。《明穆宗實錄》卷68，隆慶二年三月癸巳及田生金：《按粵疏稿》卷3《陳海防疏》；參見湯開建：《明朝在澳門設立的有關職官考證》，載《澳門開埠初期史研究》，第185頁。

嘉靖四十三年(1564年1月14日─1565年1月31日)11月11日，由兩廣總督吳桂芳奏請在東莞南頭增設海防參將一員，領兵3000人，內固省城，外援諸郡，近杜里海奸賊，遠防澳門番夷，及彈壓香山濠鏡澳等處夷船並巡緝接濟私通船隻為其主要責任。應檟、劉堯誨：《蒼梧總督軍門志》卷24《請設海防參將疏》。