2004年
1月1日，《内地与澳门关于建立更紧密经贸关系安排》正式实施，具体实施领域主要包括：在货物贸易方面，共有273项本澳产品，可享受零关税打入内地市场。服务贸易方面，内地共有18个主要服务行业的市场对合资格的本地服务提供者放宽准入条件。在贸易投资便利化方面，则有7项措施简化两地之间的贸易程序。
2月2日，施工期长达两年、耗资约1.35亿澳门币的关闸新边检大楼启用，大楼内71个出入境柜台能每日处理30万人次出入境，而设有22条进出境车辆通道，每日可处理2.4万辆次出入境车辆。
2月9日，行政会完成讨论《行政长官选举法》，规定选举委员会须于10月19日前选出第二任特首。
2月18日，本澳首间美资娱乐场——金沙（Sands）开业，同时，亦宣告本澳博彩市场开放时代正式来临。
6月1日，标志泛珠三角区域合作正式启动的“泛珠三角区域合作与发展论坛” 香港开幕。中共中央政治局委员、广东省委书记张德江、香港特区行政长官董建华、澳门特区行政长官何厚铧、广东省省长黄华华、福建省常务副省长黄小晶、江西省省长黄智权、湖南省省长周伯华、广西壮族自治区副主席杨道喜、海南省省长卫留成、四川省省长张中伟、贵州省省长石秀诗、云南省省长徐荣凯等嘉宾出席，期以“9＋2”全方位合作推动相关各方加速发展。
7月4日，耗资5亿澳门元的银河华都娱乐场及华都酒店开幕。
7月11日，为庆祝特区成立5周年，进一步凝聚和提升居民的爱国爱澳情怀，澳门基金会实施庆祝澳门特区成立5周年特别计划，包括津贴社团举办联欢活动。
7月23日，极富文艺复兴色彩，寓意造福社会繁荣安定的“和丽女神喷泉”座落嘉思栏花园。除为市民、游客提供直接饮用食水，同时亦增添了欧陆情调。
8月29日，在澳门特别行政区第二届行政长官选举委员会会议上，何厚铧以99%的得票率顺利当选澳门特别行政区第二届行政长官。
9月6日，澳门特区政府争取多时的更方便的“澳门居民入出境香港”措施终与香港特区政府达成共识，澳门成为首个获允许不用持护照或旅游证件入出香港的地方，澳门永久性居民可从10月18日起持智能身份证赴港。
9月21日，国家主席胡锦涛在中南海接见行政长官何厚铧，肯定了他在第一任任期内的成功施政，希望他再接再厉，维护和发扬以往施政的成功经验，集中精力发展经济、维护社会稳定和谐，把澳门事情办得更好。
11月4日，经济财政司司长谭伯源在出席立法会审议《二零零三预算执行情况报告》时指出：2003年特区政府的总收入为141.2亿元，总开支为114.62亿元，最终录得26.576亿元盈余。
11月16日，施工历时19个月，造价为澳门币1.05亿元的关闸边检大楼——新广场及地下公共客运总站全部竣工，其中新广场正式启用，而地下客运总站亦在23日启用。
行政长官何厚铧发表第二届特区政府首份施政报告，并指出特区政府在2005年为继续纾解中小企业经营困难及改善市民生活质素，将延续实施多项短期税务措施，及新增两项短期税务减免措施，预计政府届时将减少税收3亿元。同时，特区政府还会设立长者津贴及调升公务员薪金5%。
12月9日，国务院根据行政长官何厚铧提名，决定原来的治澳班底全部留任，主要官员名单包括：行政法务司司长陈丽敏、经济财政司司长谭伯源、保安司司长张国华、社会文化司司长崔世安、运输工务司司长欧文龙、廉政专员张裕、审计署审计长蔡美莉、警察总局局长白英伟、海关关长徐礼恒、检察院检察长何超明。
12月15日，行政长官何厚铧委任第二届特区政府行政会10名委员，5名司长除行政法务司司长陈丽敏继续留任外，其余4人均不入阁，现任行政会委员唐志坚、梁庆庭、廖泽云、马有礼亦继续留任，加入包括厂商会理事长贺一诚、立法会议员欧安利及郑志强、工联工人权益委员会副主任林香生以及发展策略研究中心会长梁维特等新成员。
12月19日，中共总书记、国家主席、中央军委主席胡锦涛为与澳门各界庆祝澳门特区回归五周年亲临澳门，并分别到访参观大三巴、劳工子弟学校，以及到草根阶层家居探访，令澳门市民真切体会到胡主席的亲民作风；同日，胡锦涛亦主持了兴建超过两年的西湾大桥落成典礼。
12月20日，胡锦涛主席在庆祝澳门特别行政区成立5周年暨第二届特区政府就职典礼上发表重要讲话，高度评价澳门特区成功实践“一国两制”并提出“四点希望”。