Em 1634, construção da Igreja de Nossa Senhora do Amparo (Pe. André Palmeiro, S.J.) para instrução de catecúmenos e conversão de chineses. Foi mandada fechar pelos mandarins em 1747 mas a ordem não foi executada por imposição do Bispo D. Fr. Hilário de St.ª Rosa e outros religiosos.

No dia 30 de Abril de 1634, as irmãs clarissas da província franciscana de Toledo, que chegaram a Macau em 4 de Novembro de 1633 e se instalaram, ao princípio, na Ermida da Guia e depois numas casas provisórias, foram definitivamente alojadas no Convento de St.ª Clara, cuja construção juntamente com a igreja anexa foi iniciada em 1633 e ficou concluída neste ano; foi fundadora do convento a madre Maria Madalena da Cruz, nascida em Pinto, Espanha, e autora de três obras místicas, sob o título de Floresta Franciscana de Illustraciones Celestiales. Neste ano chegou também a Fuquiam, China, o primeiro Pe. franciscano, Fr. António de St.ª Maria Caballero.

A greja de S. Agostinho ruiu de 27 para 28 de Setembro de 1872.

No dia 30 de Março de 1861, autorizada por Portaria do Ministério da Marinha e Ultramar, a demolição do Convento de S. Francisco e a construção do Quartel para o Batalhão de Macau, no mesmo local. O desenho do Quartel e do Forte de S. Francisco, no lugar do antigo edifício, são da autoria do Governador José Rodrigues Coelho do Amaral, que também dirigiu as obras.