1949年新中国成立後，澳葡政府与中国之间仍见边界衝突，如1952年的“关闸事件”，双方一度武力对峙。另一个重大事件是1966年的“一二．三事件”，在殖民政府腐败的管治下，华人与葡萄牙人社群的磨擦不断增加，引发了澳门史上最严重的警民衝突，造成大批平民伤亡，在中国政府的抗议下，澳葡政府最终道歉和赔款。“一二．三事件”除了打击澳葡政府的威信之外，也把右派势力逐出澳门。
1974年，葡萄牙发生“康乃馨革命”，新政府放弃殖民主义，承认澳门为中国领土，并撤走军队。至1980年代，中国与葡萄牙就澳门的前途问题进行谈判，并於1987年签订《中葡联合声明》。在过渡期间，澳门继续由澳葡政府管治，并为回归後政治制度进行整理以便过渡。
1960年代，澳葡政府积极发展本地的旅遊业及博彩业；在70年代，本地的轻工业发展催向成熟，至80年代成为澳门工业的黄金时期。与此同时，澳葡政府在70至90年代对新口岸、黑沙环和凼仔进行开发，而澳凼大桥、友谊大桥和澳门机场等机建也在此时落成使用。
