清乾隆四十九年（1784年1月22日─1785年2月8日）10月1日，澳门圣若瑟修院开学。有学生8名；修院由遣使会士负责管理，来自果阿的科雷亚‧瓦伦特神父担任修院第一任院长。先是，葡萄牙人方济各会士汤士选主教在果阿见葡国遣使会管理的修院颇上轨道，于是他决定在澳门亦成立一座修院，遂将圣若瑟修院重新修缮，汤士选主教提供必需品，并指定规则，修院教授拉丁文和中文语法、数学、修辞学、 哲学、伦理神学等。为此他请了果阿的二位遣使会士瓦伦特和魏腊儿至澳门，在耶稣会昔日的圣若瑟修院内，收了第一批修生；一切费用由葡国女王维持，因她曾批准成立。这是澳门著名的圣若瑟修院的来历，最初是教区的，后来成为全国性的。它先后从海外招选了一批教师。后来，由于种种原因，它由开始时葡法两国遣使会士合作的局面，改变为各自为政。它的主体部分为葡国遣使会控制的圣若瑟修院葡国会院，另一部分为由法国遣使会管理的法国会院。Manuel Teixeira, Macau e a Sua Diocese, Vol. 3, p. 668; 樊国阴：《遣使会在华传教史》，第128—129，160页；卫青心：《法国对华传教政策：清末五口通商和传教自由（1842—1856）》，第88页。施白蒂：《澳门编年史：16—18世纪》，第183页；天主教台湾地区主教团宣圣委员会：《中华殉道圣人传》之《圣董文学司铎》，第130页。

光绪二十一年（1895年1月26日─1896年2月12日）10月，西洋种痘之法于嘉庆朝即已传入澳门，而华人种痘之处所主要在三街会馆。镜湖医院原拟在院内设置痘局，澳门政府不予批准。适香山县湾仔地区居民患天花者无处求医，因此，湾仔海船就医保安公所将其就医地方无条件送给镜湖医院开设痘局，以协助湾仔居民治理预防天花工作，是为镜湖医院分局，全事一体禀明香山知县立案。1915年改称广善医局。吴润生主编：《澳门镜湖医院慈善会会史：1871—2001》，第14页。

光绪十一年（1885年2月15日─1886年2月3日）1月20日，九澳女麻风病人收容所建成并交付使用。该麻风院在选址问题上遇到重重阻力并几经改变，先是在澳门（马交石、关闸），后来又是氹仔或路环，最后终于在该日将围栏及四周划定的区域一并移交完毕。驻望德堂内的最后3名麻风病人也迁出该堂前往九澳。建于望德堂已有300余年历史的麻风院终于结束。5月1日，将舵尾岛白沙栏之麻风病人全部搬往九澳。据程佐衡《勘地十说》，这次迁往九澳的仅为女麻风病人，时间是光绪十年（1884）。施白蒂：《澳门编年史：19世纪》，第237页；林家骏：《澳门第一座华人堂区》，载《澳门教区历史掌故文摘》，第78页。《澳门政府宪报》1885年6月13日第24号。《明清时期澳门问题档案文献汇编》第3册《幕客程佐衡著（勘地十说）》，第342页。

光绪二十四年（1898年1月22日─1899年2月9日）澳门各行公推镜湖医院总理12位：郑炳劭（莘农，郑宝荫堂）、曹善焜（子良，曹善荫堂）、陈树鹄（秋浦，益隆号金银行）、黄福龄（渭樵，悦记南北行）、郑天佐（以文，裕祥号绸缎行）、黄荣耀（星南，福隆烟膏行）、何仲衍（寿田，公信和闱姓行）、冼宝芳（鉴堂，林茂集木店）、林能爱（日初，成隆号酒米行）、叶钧芳（金波，顺益山货行）、苏良材（骏声，屈臣氏药材行）、黎自成（杏邮，公源番摊行）。《镜湖医院征信录》上，第16页。

光绪二十八年（1902年2月8日─1903年1月28日）澳门各行公推镜湖医院总理12位：杨乃安（杨永修堂）、吴寿年（子良，宝兴按）、刘廷松（跃泉，厚德号金银行）、张佐荣（赞卿，恒昌荣绸缎行）、尤泰汾（霭泉，广发昌南北行）、冯辉南（辉南，顺泰号杉集店）、陈子添（桂芬，悦栈号酒米行）、梁焯英（廷辉，顺安鱼务公司）、黄茂梁（植楠，裕隆号油店）、陈星朝（文照，信合号咸鱼行）、李贤连（霭春，允成山货店）、余炽华（植楠，永和号公白行）。《镜湖医院征信录》上，第16—17页。

光绪二十一年（1895年1月26日─1896年2月12日）澳门各行公推镜湖医院总理12位：萧启基（衍波，泰隆号金银行）、黄炳行（焯垣，协昌号南北行）、吴雄光（盘石，昆安号疋头行）、谭俭成（俭生，三店油烛号）、郑玉南（伟堂，信和栏鲜咸鱼号）、郭銮杰（鉴昌，兴记油米店）、梁广发（煊礼，荣茂泰杉集木号）、陈竹兴（月屏，昌盛正烟丝行）、张意求（则堂，连益号堂山货店）、吴建科（干廷，永安隆洋货店）、宋文耀（照寰，宋永康堂）、曹善麟（子祥，曹永荣堂）。《镜湖医院征信录》上，第15页。

光绪三十年（1904年2月16日─1905年2月3日）澳门各行公推镜湖医院总理12位：官文斗、邓鉴泉（经昌号洋货行）、唐丽泉、梁蔚廷（冯利兴烟丝行）、李镜波（汇通银号）、苏丽初（瑞昌号山货店）、周霭臣（广茂号绸缎行）、黎锐生（公源馆番摊行）、黎玉亭（茂隆号杉集店）、叶瑞初（昆泰号鱼栏行）、陈达亭（恒安公所南北行）、陈沛章（广益永义堂）。《镜湖医院征信录》上，第17页。

光绪二十七年（1901年2月19日─1902年2月7日）澳门各行公推镜湖医院总理12位：周荣耀（东生，周荣禄第）、蔡文（松溪，蔡余庆堂）、尹英材（英材，广聚源南北行）、郑明泰（子坚，永裕号金银店）、朱凤翔（鸣岗，信章号绸缎行）、张汝成（良清，林盛号杉集店）、谭俭成（俭生，三记号杂货店）、赵衍庆（景堂，永安号纸料店）、张千玨（秀石，福昌号故衣店）、李殿材（树堂，利丰号洋货店）、苏水衡（卉波，和兴号山货行）、陈国宾（竹友，义德公司）。《镜湖医院征信录》上，第16页。

光绪二十六年（1900年1月31日─1901年2月18日）澳门各行公推镜湖医院总理12位：何启东（晓生，何昌远堂）、林德远（历洲，林德远堂）、潘以恩（礼臣，泰和号金银行）、杜鸿志（云轩，行安号南北行）、黎启珍（润生，广章号绸缎行）、张信森（植庭，茂盛杉集店）、杜锡龄（寿南，昌盛正烟丝店）、潘泽良（柏泉，占元闱姓厂）、余扬章（锡臣，永昌盛洋货行）、邓钦明（焯辉，泉记号鱼栏行）、罗传晖（逸云，和昌酒米店）、陈锡洪（梅生，翰芳号纸料）。《镜湖医院征信录》上，第16页。